Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt34Q9D646 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt34Q9D646 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms