Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc7Q9D541 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc7Q9D541 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms