Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Zc2hc1bQ9D534 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Zc2hc1bQ9D534 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms