Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Efhd1Q9D4J1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Efhd1Q9D4J1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms