Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Mrpl53Q9D1H8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl53Q9D1H8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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