Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddx56Q9D0R4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddx56Q9D0R4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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