Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc18Q9CZJ9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc18Q9CZJ9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms