Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tm4sf20Q9CQY8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms