Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab5aQ9CQD1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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