Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms