Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms