Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tubb6Q922F4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms