Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf185Q91YT2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms