Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms