Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Smg8Q8VE18 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Smg8Q8VE18 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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