Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Fam20bQ8VCS3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Fam20bQ8VCS3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms