Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cdc34Q8CFI2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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