Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ercc8Q8CFD5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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