Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ubash3bQ8BGG7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms