Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms