Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms