Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp8b3Q6UQ17 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp8b3Q6UQ17 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms