Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms