Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt40Q6IFX3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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