Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hist2h2beQ64524 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hist2h2beQ64524 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms