Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprdQ64487 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms