Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Sox16Q62247 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Sox16Q62247 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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