Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SelplgQ62170 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
SelplgQ62170 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms