Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Syne3Q4FZC9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Syne3Q4FZC9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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