Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pfdn4Q3UWL8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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