Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Rnf166Q3U9F6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rnf166Q3U9F6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rnf166Q3U9F6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms