Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rnf149Q3U2C5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Rnf149Q3U2C5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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