Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atp2b3Q0VF55 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms