Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gata4Q08369 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gata4Q08369 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms