Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sh3bp2Q06649 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sh3bp2Q06649 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp2Q06649 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms