Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb4Q02738 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb4Q02738 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms