Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms