Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx3P81067 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms