Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux2P70298 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cux2P70298 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms