Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gnb1P62874 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms