Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ube2d3P61079 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ube2d3P61079 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ube2d3P61079 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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Ube2d3P61079 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Ube2d3P61079 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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