Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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