Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Defb1P56386 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms