Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp1P55194 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp1P55194 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Sh3bp1P55194 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sh3bp1P55194 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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