Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Defa11P50709 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms