Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms