Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cdkn1bP46414 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms