Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtgfrP43117 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms