Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Timp3P39876 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Timp3P39876 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms