Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdh15P33146 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms